MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 87465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016112	TGT	2	6	241115	241120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_016112	TAAA	2	8	241121	241128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_016112	GAC	2	6	241158	241163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403602
4504	NC_016112	A	6	6	241164	241169	100 %	0 %	0 %	0 %	357403602
4505	NC_016112	TTG	2	6	241335	241340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403602
4506	NC_016112	GAA	2	6	241347	241352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403602
4507	NC_016112	TTA	2	6	241388	241393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403602
4508	NC_016112	ACA	2	6	241465	241470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403602
4509	NC_016112	TGA	2	6	241490	241495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403602
4510	NC_016112	GAA	2	6	241617	241622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403602
4511	NC_016112	CGCT	2	8	241638	241645	0 %	25 %	25 %	50 %	357403602
4512	NC_016112	AAGC	2	8	241718	241725	50 %	0 %	25 %	25 %	357403602
4513	NC_016112	AAT	2	6	241743	241748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403602
4514	NC_016112	CGC	2	6	241827	241832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403602
4515	NC_016112	TGCCGA	2	12	241888	241899	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	357403602
4516	NC_016112	GAAT	2	8	241939	241946	50 %	25 %	25 %	0 %	357403602
4517	NC_016112	TTG	2	6	242085	242090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403602
4518	NC_016112	CAA	2	6	242114	242119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403602
4519	NC_016112	CAT	2	6	242165	242170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403602
4520	NC_016112	ATC	2	6	242376	242381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403602
4521	NC_016112	CCG	2	6	242410	242415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403602
4522	NC_016112	ACA	2	6	242531	242536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403602
4523	NC_016112	GATT	2	8	242563	242570	25 %	50 %	25 %	0 %	357403602
4524	NC_016112	AAGG	2	8	242814	242821	50 %	0 %	50 %	0 %	357403602
4525	NC_016112	GAC	2	6	242870	242875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403602
4526	NC_016112	TGC	2	6	242887	242892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403602
4527	NC_016112	GA	3	6	242904	242909	50 %	0 %	50 %	0 %	357403602
4528	NC_016112	TGC	2	6	243044	243049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_016112	CCT	2	6	243249	243254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_016112	T	6	6	243322	243327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_016112	TCA	2	6	243361	243366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_016112	CTG	2	6	243598	243603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403603
4533	NC_016112	TCG	2	6	243607	243612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403603
4534	NC_016112	GTC	2	6	243642	243647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403603
4535	NC_016112	GTA	2	6	243741	243746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403603
4536	NC_016112	GCA	2	6	243777	243782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403603
4537	NC_016112	CGAAC	2	10	243932	243941	40 %	0 %	20 %	40 %	357403603
4538	NC_016112	CAT	2	6	243977	243982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403603
4539	NC_016112	CGG	2	6	244030	244035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403603
4540	NC_016112	AG	3	6	244052	244057	50 %	0 %	50 %	0 %	357403603
4541	NC_016112	AAC	2	6	244194	244199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403603
4542	NC_016112	TGC	2	6	244270	244275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403603
4543	NC_016112	GT	3	6	244491	244496	0 %	50 %	50 %	0 %	357403603
4544	NC_016112	CAA	2	6	244529	244534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403603
4545	NC_016112	CGGC	2	8	244583	244590	0 %	0 %	50 %	50 %	357403603
4546	NC_016112	GAC	2	6	244598	244603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403603
4547	NC_016112	GCC	2	6	244680	244685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403603
4548	NC_016112	ATC	2	6	244768	244773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403603
4549	NC_016112	GAC	2	6	244800	244805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403603
4550	NC_016112	CCTGAA	2	12	244812	244823	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	357403603
4551	NC_016112	CGT	2	6	244826	244831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403603
4552	NC_016112	GCA	2	6	244849	244854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403603
4553	NC_016112	GGC	2	6	244884	244889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403603
4554	NC_016112	TAATCG	2	12	245008	245019	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	357403603
4555	NC_016112	GAC	3	9	245081	245089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403603
4556	NC_016112	ATCG	2	8	245100	245107	25 %	25 %	25 %	25 %	357403603
4557	NC_016112	AAT	2	6	245149	245154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403603
4558	NC_016112	T	8	8	245228	245235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_016112	TTC	2	6	245332	245337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_016112	CCT	2	6	245633	245638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4561	NC_016112	AAG	2	6	245673	245678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_016112	CTTT	2	8	245691	245698	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4563	NC_016112	GT	3	6	245709	245714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_016112	T	6	6	245730	245735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_016112	AAAC	2	8	245748	245755	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4566	NC_016112	CA	3	6	245833	245838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4567	NC_016112	CGCAG	2	10	245847	245856	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4568	NC_016112	TTTTAA	2	12	245866	245877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_016112	CGA	2	6	245944	245949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403604
4570	NC_016112	AG	3	6	246146	246151	50 %	0 %	50 %	0 %	357403604
4571	NC_016112	TG	3	6	246185	246190	0 %	50 %	50 %	0 %	357403604
4572	NC_016112	TGAG	2	8	246192	246199	25 %	25 %	50 %	0 %	357403604
4573	NC_016112	GGA	2	6	246245	246250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403604
4574	NC_016112	CGG	2	6	246265	246270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403604
4575	NC_016112	ATT	2	6	246287	246292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403604
4576	NC_016112	ATT	2	6	246375	246380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403604
4577	NC_016112	CA	3	6	246427	246432	50 %	0 %	0 %	50 %	357403604
4578	NC_016112	AGA	2	6	246467	246472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403604
4579	NC_016112	TTC	2	6	246534	246539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_016112	TTAAG	2	10	246769	246778	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_016112	ATGG	2	8	246821	246828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_016112	CTTAA	2	10	246884	246893	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4583	NC_016112	TTTCGA	2	12	247027	247038	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4584	NC_016112	AGG	2	6	247072	247077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_016112	CAG	2	6	247087	247092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_016112	CGT	2	6	247123	247128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_016112	GGTGG	2	10	247155	247164	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_016112	CGG	2	6	247213	247218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_016112	GGC	2	6	247224	247229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_016112	CGA	2	6	247245	247250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_016112	CAT	2	6	247262	247267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_016112	GTT	2	6	247272	247277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_016112	GAA	2	6	247343	247348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_016112	CAAGG	2	10	247422	247431	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4595	NC_016112	AAAC	2	8	247476	247483	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4596	NC_016112	AAG	2	6	247545	247550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_016112	TAA	2	6	247712	247717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_016112	ACC	2	6	247751	247756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4599	NC_016112	GGAG	2	8	247797	247804	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_016112	GA	3	6	247807	247812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_016112	CCG	2	6	247839	247844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4602	NC_016112	CT	3	6	247845	247850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_016112	TCG	2	6	247866	247871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_016112	ACA	2	6	247917	247922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_016112	CAA	2	6	247923	247928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_016112	AT	3	6	247963	247968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_016112	CGTT	2	8	248128	248135	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4608	NC_016112	TGA	2	6	248157	248162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_016112	TCA	2	6	248292	248297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_016112	GAC	2	6	248397	248402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_016112	T	6	6	248435	248440	0 %	100 %	0 %	0 %	357403606
4612	NC_016112	GAT	2	6	248514	248519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403606
4613	NC_016112	CGC	2	6	248567	248572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403606
4614	NC_016112	TCG	2	6	248618	248623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403606
4615	NC_016112	GGCC	2	8	248651	248658	0 %	0 %	50 %	50 %	357403606
4616	NC_016112	TAAC	2	8	248690	248697	50 %	25 %	0 %	25 %	357403606
4617	NC_016112	ATA	2	6	248712	248717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403606
4618	NC_016112	TAA	2	6	248764	248769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403606
4619	NC_016112	CAGG	2	8	248820	248827	25 %	0 %	50 %	25 %	357403606
4620	NC_016112	TGT	2	6	248846	248851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403606
4621	NC_016112	C	6	6	248858	248863	0 %	0 %	0 %	100 %	357403606
4622	NC_016112	GCC	2	6	248883	248888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403606
4623	NC_016112	GGC	2	6	248904	248909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403606
4624	NC_016112	TGA	2	6	248927	248932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403606
4625	NC_016112	A	6	6	248949	248954	100 %	0 %	0 %	0 %	357403606
4626	NC_016112	GAT	2	6	249063	249068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403606
4627	NC_016112	AAT	2	6	249171	249176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403607
4628	NC_016112	AT	3	6	249185	249190	50 %	50 %	0 %	0 %	357403607
4629	NC_016112	TTG	2	6	249208	249213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403607
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4631	NC_016112	TGA	2	6	249323	249328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403607
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4639	NC_016112	CAA	2	6	249834	249839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403608
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4720	NC_016112	GCT	3	9	253335	253343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403612
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4730	NC_016112	AGG	2	6	253749	253754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4731	NC_016112	CCAT	2	8	253803	253810	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4732	NC_016112	ACG	2	6	253885	253890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4734	NC_016112	A	6	6	253983	253988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4735	NC_016112	T	6	6	254173	254178	0 %	100 %	0 %	0 %	357403613
4736	NC_016112	CGG	2	6	254179	254184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403613
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4740	NC_016112	TAA	2	6	254458	254463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403613
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4743	NC_016112	CTTTTA	2	12	254610	254621	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	357403613
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4748	NC_016112	GA	3	6	254885	254890	50 %	0 %	50 %	0 %	357403613
4749	NC_016112	GGC	2	6	254898	254903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403613
4750	NC_016112	CAA	2	6	254972	254977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403613
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4995	NC_016112	TTAAG	2	10	268247	268256	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4997	NC_016112	TC	3	6	268349	268354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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